SearchGUI — это программная оболочка с открытым исходным кодом, предназначенная для облегчения проведения анализа данных масс-спектрометрии протеомики. Одной из главных особенностей SearchGUI является ее способность интегрировать работу с множеством популярных поисковых движков, используемых в области идентификации белков, таких как X!Tandem, MS-GF+, OMSSA, Comet и многие другие.